Sanktuarium Matki Bożej Fatimskiej w Zakopanem to miejsce o wyjątkowej atmosferze, które przyciąga pielgrzymów i turystów z całego świata. Z terenu wokół świątyni roztacza się widok na masyw Giewontu, z widocznym na wierzchołku krzyżem. Jest to idealne miejsce na chwilę kontemplacji i odpoczynku. Godziny otwarcia: codziennie od 7:00 do 20:00. Obok sanktuarium znajduje się duży parking samochodowy.
Kult maryjny obecny był na Krzeptówkach już przed powstaniem sanktuarium. W 1950 roku przybyli tu ojcowie pallotyni, którzy zbudowali dom zakonny oraz kaplicę pod wezwaniem Niepokalanego Serca Maryi. W 1961 roku prymas Polski, Stefan Wyszyński, przekazał zakonnikom figurę Matki Boskiej Fatimskiej, która w czasach komunizmu krążyła między polskimi parafiami, a w jej przekazaniu pośredniczył biskup z Fatimy. Podczas zamachu na Jana Pawła II w Watykanie, kaplica ojców pallotynów stała się miejscem modlitw o uratowanie życia Papieża. 13 maja 1981 roku ks. Mirosław Drozdzek zadeklarował: "Jeżeli Matka Boża Fatimska uratuje życie Ojca Świętego, wybudujemy tutaj kościół, który będzie symbolem zwycięstwa Matki Bożej Fatimskiej." Budowę sanktuarium rozpoczęto w 1987 roku. W kamieniu węgielnym umieszczono kamienie z grobu św. Piotra w Watykanie oraz z miejsca objawień Maryjnych w Fatimie. W fundamentach znalazły się również różańce, zdjęcie Jana Pawła II oraz cudowne medaliki.
Budowę ukończono w 1992 roku, a świątynię konsekrował Jan Paweł II w 1997 roku. Wnętrze kościoła nawiązuje zarówno do kultu Matki Bożej, jak i osoby Papieża.
Prezbiterium kształtem przypomina papieską tiarę.
Tabernakulum nawiązuje do monstrancji.
Witraże przedstawiają momenty związane z papieżem i kultem fatimskim, w tym zamach na Jana Pawła II.
Płaskorzeźby drogi krzyżowej zawierają wątki papieskie: w V stacji krzyż niesie Ojciec Święty zamiast Szymona z Cyreny, a w XII stacji przy krzyżu stoi Papież zamiast Jana.
Sanktuarium powstało dzięki datkom tysięcy ofiarodawców, którzy zostali upamiętnieni na tabliczkach na ścianach zewnętrznych oraz na ławkach wewnątrz kościoła.
Przed wejściem znajduje się pomnik Jana Pawła II, skierowany twarzą w stronę Giewontu. Ogrodzenie sanktuarium symbolizuje różaniec, a z boku ustawiono replikę krzyża na Giewoncie. Za kościołem znajduje się ogród papieski z ołtarzem, przy którym Papież odprawił mszę pod Wielką Krokwią podczas swojej pielgrzymki w 1997 roku. Jest to jeden z dwóch ołtarzy z czasów pielgrzymkowych Jana Pawła II zachowanych w Polsce w oryginale. W ogrodzie ustawiono również drugi pomnik przedstawiający Papieża w towarzystwie Stanisława Dziwisza.